Ниже код на PowerShell для удаления ContentType. Это код для удаления ContentType на уровне сайта, для коллекции сайтов нужно заменить $spweb.AvailableContentTypes на (Get-SPSite http://spdev).RootWeb.AvailableContentTypes[$ctypeName].

Удалить ContentType из сайта SharePoint

 

Удалить ContentType из коллекции сайтов SharePoint